mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGAATGACTTGCCTA GGTGGGTCTTCTTGGCTAGCC ATGGAGATGGAGAGCCTCCCTTGATTTTGGTAGCCAAGAATGACTTGCCTATGCTTGCCCTCTGCTAACCAGCTAGCCATGCATGGTAACCAATGGACAAATTTCTTGTGGTTGGCGTGGTTAGTGTGGTTGCATGGGTGGGTCTTCTTGGCTAGCCAGAGCGGCTCTCATCCACCATGCCAGGCCA 2 2 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR169_5 0.00000000005 sbi-MIR169i 0.00000000004 -87.51 ((((.((((.((((((.(.......(((((((((((((((.((((..(((((((..(((..(.(((((((((((((((((...(((...)))..(((......))).))))))))).))))))))).))).)))))))..))))))))))))).))))))).))))))))))..))))......... (-87.51)