mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTG GGCAGTCTCCTTGGCTAGC GGTGTTGCGTGGGCAGAGAAGAAGCCTTACATGGCAGCAAGGGGCTTATCTCTGATAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCATACTTCAAGGCTTGGCAACATGATGCATGAGCCTTTGTTGTAGTCTCATAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCTGAGTGGCTCTTGCGGCTCATGCCAGGCTG 0 2 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR169_5 0.000000000003 far-MIR169 1e-17 -87.2 (((.(.((((((((.........(((......))).(((((((.(....(((...((((((((((.((((.(((((((...(((..((((((((((((......))).)))))).)))..)))....)))))))))))))))))))))....))).).))))))).)))))))).).))). (-87.20)