mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATCTTGATGATGCTGCAT GCAGCACCACCAAGATTCACA AGGCGGCACGCACAGTCGGCGCTTGCAGGTGCAGCACCACCAAGATTCACATCGGGTTCTCCAGTCGTAATTAATTAACGAGGAGTACAACCATGATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAACCGCTCGACTACTCATCATATCGTCAAT 3 0 3' arm Brachypodium_distachyon mirbase mir-172 0.000000002 osa-MIR172d 0.00000000000003 -66.23 .(((((.......((((((((.((((.(((((((((.((.((((((((.(((((((((((((..((((.........))))))))...)))).))))).)))))))).)).))))))))).)))).))).)))))..........)))))... (-66.23)