mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAATCTTGATGATGCTGCAT GTGGCATCATCAAGATTCACA GTTCGCGGCGACCAGTCGGTGATTTCTGCTGTGGCATCATCAAGATTCACACAAATGCATGCTAGCTTCGTCTATGCCATCCTTTCTCATCTTTCGATCTCGATCTCGGCCCTAATTAAGTAATTATACCCAATTGTGGATCGGCCGGATTGGAGATCGATGGATGCGTGGAGAGGAGCTAGATTAGCTATAGCTTATGTGTGGGAATCTTGATGATGCTGCATCGGACATCAGTGACTAAAACAAGTATGGCA 4 0 3' arm Brachypodium_distachyon mirbase mir-172 0.0000000003 osa-MIR172b 0.00000000001 -111 ....((.((....(((((.((((.((((.((..(((((((((((((((.((((.(((...(((((((..(((((.((..(((((((((((((.((((((((((((.(((((.....(((....)))...(((....)))...))))))))).)))))))).)))))...))))))))))))))).))))..))).))).)))).)))))))))))))))..)).)))).)))).))))).......))...)). (-111.00)