mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGTGTTTGGGGGAACTC GTTCCTTTGCAAGCATTTCACG TGGTATTACCATGAGTTCCTTTGCAAGCATTTCACGTACGAGGCACTATCCCAAGGGCTATTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGTGTCACCA 0 2 3' arm Brachypodium_distachyon mirbase mir-395 0.00000002 bdi-MIR395l 1e-24 -43.1 .(((..(((((.(((((((((..(((((((((((((....((.(.((......))).))..)))))))))))))))))))))).)))))..))). (-43.10)