mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTG GTTCAATAAAGCTGTGGGAAA CGGTAGCAAATCGCATGGCCCTCTCTGTGATCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCTCGGATCTGCCTAATTAGATCACGGCTTGGGTTTGCACGAGAGGGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAATTTCAGAGAGAGGCCAATTGATCGGCACATA 1 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR396 0.0000000001 sbi-MIR396b 0.000000000008 -76.7 ..((.((..((((..((((((((((((.(((.((((((((((((.(((((((((((.((((((......)))))).((((........)).))...))))))))))).)))))))))))).))).))))))).)))))..))))..))))... (-76.70)