mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTG ACTTAGCTTATGCTTAACTGCAAGAGTGCTGTTCAATAAAGCTGTGGGAAA TATTGGATGCATGCATGGCCCTCTTTGCTATCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTGCAATGGATGCTACTTAGCTTATGCTTAACTGCAAGAGTGCTGTTCAATAAAGCTGTGGGAAATTGCAGAGAGAGACCAATTGGGCAGCTTAAT 2 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR396 0.000000009 sbi-MIR396a 0.00000000000003 -61.3 ........((.(((.((((.((((((((.((.((((((((((((.((((((.((((((.....))))))......((((.(((......))).))))...)))))).)))))))))))).)).)))))))).).))).....)))))..... (-61.30)