mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGAGTGCAGCGTTGATGAA CACCGGCGCTGCACACAGTGA GCGAAGAGGAATTAGAAGAGGCGCAAAGGCATCATTGAGTGCAGCGTTGATGAACAGGGGCCAGGCGACCGGCGGCCGGTCCGGTTCGGTTCACCGGCGCTGCACACAGTGACGCCCTTGCATTCTCTGGCCCGATTCATTTGTGTGCGAAGAGGAATTAGAAGAGGCGCAAAGGCATCATTGAGTGCAGCGTTGATGAACAGGGGCCAGGCGACCGGCGGCCGGTCCGGTTCGGTTCACCGGCGCTGCACACAGTGACGCCCTTGCATTCTCTGGCCCGATTCATTTGTGT 2 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR397 0.000000005 bdi-MIR397a 8e-66 -158.5 (((((...((((..(.(((((.((((.(((.((((((.(((((((((((.(((((..(((((..(.(((((((.(((((((((((((.(((((.(((((((((((.((((((.(((.((((..(((((...(..((((.((((....))))...))))..).))))).)))).))).)))))).))))))))))).)))))..)))))..).))))))).))))))))))))).))))).))))))))))).)))))).))).))))..)))))...)..)))).))))).. (-158.50)