mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTCTCAGGTCGCCCCTG GGGTCGAATTGGGAACACATG CAGCACATGCGAGGAAGTTCCTGCAGGGTCGAATTGGGAACACATGAGATGGATGGTCCGCTGAGCTCTGAGCTCGAGCTCGGCCATGTGTTCTCAGGTCGCCCCTGTTGGGTCTTCCGTGCCATGGATTG 2 0 3' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR398 0.0001 bdi-MIR398a 2e-70 -67.9 (((..((((((.(((((..((.((((((.(((.(((((((((((((....((.....))(((((((((.......)))))))))))))))))))))).))).)))))).))..))))).)).))))..))) (-67.90)