mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCAAAGGAGAATTACCCTG GTGCAGTTCTCCTCTGGCATG CAGTGCAGTTCTCCTCTGGCATGGATGCTAATGTAGCAGGCCCTGCACAATGGACTATGCTATCACTGTCCCTGCCAAAGGAGAATTACCCTGCCAGTGC 3 0 3' arm Brachypodium_distachyon mirbase mir-399 0.00000000009 sbi-MIR399h 0.000000005 -37 (((.(.(((((((((.(((((.((((......((((((((.((........)).)).))))))....)))).))))).))))))))).).)))....... (-37.00)