mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCTGCCTCAAGCTTGCTGC GTCCGACTAGAGGCAGCAACT CACGCGTCCGACTAGAGGCAGCAACTCCATAACTTGCGGAAAGCTTGTTGGATGATGACCATGCCAATGATTTTACCGAAGTTATGCAGTTGCTGCCTCAAGCTTGCTGC 2 2 3' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR444 0.0000000000004 osa-MIR444e 1e-25 -49.6 ...(((..(((((.((((((((((((.((((((((.(((.(((.(..(((((((.....))).))))..).))).))))))))))).)))))))))))).)).))).))) (-49.60)