mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAGATGACCATCAGCAAACA TTTTGTTGGTTGTCATCTAACC ATTGAGCCGATTCATGCAGCTCTGAACTTGTTTTGTTGGTTGTCATCTAACCATCGATCGGTCCGTGCTTCGGTGCTTGTGCCATGATTTTGCATCATCACACCGGCGATGGTTAGATGACCATCAGCAAACATGTTCGTGAGACATGCCGTGCGTCCTGAGCT 1 1 3' arm Brachypodium_distachyon mirbase 100 osa-MIR827b 0.0000000005 -69.6 ....(((((((.((((((.((((((((.(((((.((((((.(((((((((((((((.((((...(..(....)..)..(((..(((((.....)))))))).))))))))))))))))))).))))))))))).))))).)))...)).)))).)))..).))) (-69.60)