mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACTACTCCCTCCGTCCGATA TCCACCGGGACAAGTTAGTTAACTACTCCCTCCGTCCGATATTAAGTGGCATTCTATTACATGTATCTAAACGTTTTTTAAAGAGATACATTAGTATTTGGACCAAACTTGAGTCACT 10 100 3' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR1122 0.00000000003 100 -23.36 ......((((..((((....))))..)))).......(((.((((((.....((((.(((((((((((...............))))))))..)))..))))....)))))))))... (-23.36)