mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCGGGTAGAGCGGGTATGGGTAT AACCCATACCCTTTTACCCGATTA CTTCGTACCCATCGGGTAGAGCGGGTATGGGTATGGGAATGCATAACCCATACCCTTTTACCCGATTACCCGTATA 0 2 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase 100 100 -36.6 ....((((..(((((((((((.(((((((((((((......))).))))))))))))))))))))).....)))). (-36.60)