mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCAACTTTGTCTAGATACGC GTATCTAGACAAAATTGTGAC GTATTAAAAACTATGCTCTTGGGATAACTAGTACTCCCTCCGTCCCATAGTTAGTATCGCAACTTTGTCTAGATACGCATGTACCTACACACTAAAAAGCGTCTGGATACATGCGTATCTAGACAAAATTGTGACACTTAATATGGGACGGGGAGGGAGTAACAAA 1 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR1122 0.0000000006 osa-MIR818d 0.000002 -81.1 ((((........))))...(((.....))).((((((((((((((((((...(((.((((((.((((((((((((((((((((.(((.((.((....)).)).))).)))))))))))))))))))).)))))).)))...))))))))..))))))))))..... (-81.10)