mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGGTGATCTCGGACCAGGC CTGGTTCAAGGTCTCCACATA CTGCATGTCCAGGTTGAAGTTAGGTTAAGGGGGTTGTTGTCTGGTTCAAGGTCTCCACATACATCATGTACATGGAGGGCATGCATGCATGATATGCTGTTGTTGAGTGCCATTTGCTCGATCTTGTGTATATATGCAGTGTATGATGTGGTGATCTCGGACCAGGCTTCGATCCCTTTAACCAGCATCTGCACAGTACTTGCACCTC 2 0 3' arm Brachypodium_distachyon mirbase mir-166 0.0000000002 osa-MIR166l 0.00000000000001 -86.7 .((((.(((...((.((.(((.((((((((((((((..(((((((((.(((((.(((((..(..(((....)))..)..((((((((((((((((((....(((((((.......)))))))...)))))).)))))).)))))).))))).))))).)))))))))..))))))))))))))))).)).))...).)).)))).... (-86.70)