mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGACCAAGTTTGTAGAACA TTCTATAAACTTGGTCAAATT TCCTTTTTATAAGATGTTCTAGCTTTGTCTCTTGAAGTTTGACCAAGTTTGTAGAACAGTATACTAATATCTAACAGTATCAAATAAGTATACTATGAAGATATATGCAATTGAGGATTTAATAAAACTAATTTAGAGTTGTAGATGTTGGTATATTTTTCTATAAACTTGGTCAAATTTAAAAAGTTTGAATTGGAACAAAGCTAGAAC 1 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase 100 sbi-MIR437b 0.00000004 -71.6 ...............((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((......((((....(((((((....)).)))))....))))...........((((.......)))).)))))))))))))))).))))))))))))))))))))))...)))........)).))))))))))))) (-71.60)