mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTTAATATGGGACGGAAGAA CCTACTTCTCATATTACGTGC ATTCAAACATTTGCCAAAATTGCATGCTTCCTACTTCTCATATTACGTGCCGAAATTTTACATAGATCTATATACATTCATATTTGAACAAATTTAAGTCACTTAATATGGGACGGAAGAAGTATGTTATTTTACCGTCGCGTTAGCTGACGTG 5 0 3' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR1122 0.00000000004 100 -36.9 ...............(((((.(((((((((...(.((((((((((.((((..((((((...(((......)))...((((....)))).))))))..).))).)))))))))).)...))))))))).)))))..((((((....)).)))).. (-36.90)