mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCCGTTCCATAAAGATTGGC CAATCTTTATGAAACGGAGGG CAAGTTTATTAAAATTCATAGATCTTACTTACTCCGTTCCATAAAGATTGGCGTGAATTTGAACTAGAGCTAGTTTAAATCCGTGCCAATCTTTATGAAACGGAGGGAGTACAACAGAGTCAGTCATGACTTGGCAGATTTTGCAAGATCGAGTCGACGTAGAGCT 1 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR1122 4e-17 100 -63.82 ..(((((......((((...(((((((((..(((((((.((((((((((((((((.((((((((((....)))))))))).)))))))))))))))).)))))))..))))...(((((((.((((.....)))).)))))))..))))))))).......))))) (-63.82)