mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTCTGTTCCTAAATTCTTGT AAGAATTTAGGAATGGAGGGA TCCAAGTTGGTGTTTGCGTGATTCAGAACTACTTCCTCTGTTCCTAAATTCTTGTCATTGTTTTAGTTCAAATTTGTATTAAAGCCACGACAAGAATTTAGGAATGGAGGGAGTATGAGATATGCTACTCCCTTAGCTTTT 0 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR1122 0.0000000000001 bdi-MIR5175a 8e-18 -59.3 ...(((((((.((..(((((.((((....(((((((((((((((((((((((((((...((((((((.((....)).))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))).))))).)).))...))))).. (-59.30)