mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGCCATGTCGTCACATATC TATGTGATGATGTGGCATAGA AGTTTATTCTCTTTTCACACGTTCTCTCATTTATTCTATGCCATGTCGTCACATATCCTACATGGCAATATTTACCAACATGCTATGTAGGATATGTGATGATGTGGCATAGAATGCGAGGAGAGAGAGCAAACTTGTATGTGCAACA 0 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase 100 bdi-MIR5176 2e-80 -71.32 (((((.((((((((((....(......)...((((((((((((((((((((((((((((((((((((.............))))))))))))))))))))))))))))))))))))...)))))))))).)))))............. (-71.32)