mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATCCATAATAAGTGTCAGG CGGCACTTATTATGGATCAGA GCATGCCAAGCTATGTTTTATGTACTCCTTCTGATCCATAATAAGTGTCAGGAATTTAGTACAAAGTTACTTTGTACTAAATCCCCGGCACTTATTATGGATCAGAGGGAGTAAGAAAATATTAACTTTGTACTAAATCCC 1 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR1122 4e-17 bdi-MIR5181b 0.00000003 -71.1 ...(((.(((..(((((((...(((((((((((((((((((((((((((.((.(((((((((((((...))))))))))))).)).)))))))))))))))))))))))))))..)))))))...))).)))......... (-71.10)