mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCGATCCATAATAAGTGTCG ACATTTATTATGGATCGGAGGGAGT CCGTTAAGATGAAAATGAACATGAATTATACTCCGATCCATAATAAGTGTCGGGGATTTAGTACATTAGCATAACTTTGTACTAAATCTCCGACAGGCCGACATTTATTATGGATCGGAGGGAGTATGATTTGAGATAGTAGGTAATCAAA 0 4 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR1122 0.000000002 bdi-MIR5181a 0.00000003 -57.1 ..(((...((....)).)))..(((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((..((.....)).))))))))))).((....)))))))))))))))))))))....))))))))))))..(((........)))... (-57.10)