mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCTAGTTCATTTTTCAAATC TTTGAGAATTGAACTAGAAGC GGTGCAAACTGGATCCCACGAAAGTCCCGTTTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGCTCAAAATTTGAATAGGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGCGGGACTTTCGCGGGATGCCGTTTGCACCCTTAATTTTAACTTGA 1 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase 100 bdi-MIR5185b 3e-51 -94.4 (((((((((.(.(((((.((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((....))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))).))))).).)))))))))................ (-94.40)