mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG GAGCTCCTATCATTCCAATGA GTTTGGTTTTGAGGTGGAGCTCCTATCATTCCAATGAAAGGTCTTGCTAGGAGGGGTGGTACAGCTGCTCGTTCATGGTTCCCACTATCCTACCTCCGTTTGAAACCAGGGAGATAGGCCTGTGGCTAGCATGACCGAGGAGCCGCATCGTCCCCTCGCTGGCCGCTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCATCTTGGCCT 5 0 3' arm Festuca_arundinacea mirbase MIR159 6e-26 tae-MIR159a 9e-37 -98.8 ....((((..((.(..((((((((.(((.(((((.((..((((..((...((((((((((.(.(((.((((.(((((.(..((((...((((.((((.(........).)))).))))...))))..).))))).)))).))).).)))).)))))))).))))..)).))))).))).))))))))..).))..)))). (-98.80)