mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCACGGCGTGATGCTTAGTCAG AGTGAGCTCGCGAGCGCGGAGGAGCTGGCTCAGCGGCTCAGCGCCTCATGCCAGCCGTGCCACG CCAGCGAGTGAGCTCGCGAGCGCGGAGGAGCTGGCTCAGCGGCTCAGCGCCTCATGCCAGCCGTGCCACGGTGGCAGTCGGTCGTGTGTACTCCTACGTGGCACGGCGTGATGCTTAGTCAGCCAGCAGAGTGGAGTGCTACTTTT 2 43 3' arm Festuca_arundinacea mirbase 100 tae-MIR1119 0.000000000002 -67.1 ...((((.(((((((((..(.(((((((.(((((((....))).)))).)))).)))).(((((((((((..((.(((((......)).)))))..))))))))))))))).))))).)).))....(((((((....))))))). (-67.10)