mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGATACATCCGTATCTAGA TAGATTCAGATGTATCTAAA TCTAAAGAAGTTATTCGCTACAAGTTAACAAGATGACCGGGCATTGTACACTCAATGACCTCACAATAAGCACCATTTCATCAAAAAATTACTACTACCTCCGTCTAAAAATAAGTGTCTTAGTTTTGTCTAGATTCAGATGTATCTAAACATATTTTAGTTGTAGATACATCCGTATCTAGAAAAAGTTGAGACACTTATTTTTGTACGGAGGGAGTAGAATATTTGTTATGAAACCCAGGACATGAGTTGTTATCATACAATCTTGTGGTACATGAAGAGATAACAAAACGAAGAAGT 2 0 3' arm Festuca_arundinacea mirbase MIR1122 0.0000003 tae-MIR1135 0.0000003 -97.1 .........((((((..((.((.((..(((((((..((.(((((((......))))).))...............((((((..(((.(((.(((((.(((((((.(((((((((((((((((..(((.(((((((.(.(((((((((((((........))).)))))))))).).))))))).)))..))))))))))))))))).))))))).)))))))).)))...))))))....))..((((.......))))...)))))))...)).)).)).))))))............. (-97.10)