mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG GAGCTCCTATCATTCCAATGA GGTGGAGCTCCTATCATTCCAATGAAGGGTCTACCGGAAGGGTTTGTGCAGCTGCTTGTTCATGGTTCCCACTATCCTATCTCCATTAGAACACGAGGAGATAGGCTTGTGGTTTGCATGATCGAGGAGCCGCTTCGATCCCTCGCTGACCGCTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCA 5 0 3' arm Hordeum_vulgare mirbase MIR159 5e-20 tae-MIR159a 6e-81 -86.3 .(..((((((((.(((.(((((...((((((...((..((((.(((.((.(((.((((.(((((....((((...(((((((((............)))))))))...))))....))))).)))).))).))..))).))))))..)))).))..))))).))).))))))))..). (-86.30)