mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGATCGGGAC CCCGCCTTGCACCAAGTGAAT GTCCGTCGCCGCCGCCTCGGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCTCCGCCCGCCCCGACGGGCCGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCGGAGCCGGCGCAGCG 3 0 5' arm Hordeum_vulgare mirbase MIR168 1e-34 hvu-MIR168 2e-55 -64.4 ...(((.((.((((.(((.(..(((((((((((((..(((((...((((((((......)))).)))))))))..)))))))))))))..).))).)))))).))) (-64.40)