mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCGTTGAGTGCAGCGTTGATG CCGGCGCTGCACGCAATGACG CGCAGAGGTGCCGTTGAGTGCAGCGTTGATGAACCGTCCGGCCATGGCCCGTCCGCCTCCACCGAGGCCGGAGCGGTTCACCGGCGCTGCACGCAATGACGCCTCTGCTTTCT 3 0 5' arm Hordeum_vulgare mirbase MIR397 0.0004 osa-MIR397b 0.00002 -74.94 .(((((((((.(((((.(((((((((((.((((((((((((((.(((..............))).))))))).))))))).))))))))))).))))).)))))))))..... (-74.94)