mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCAGTTGCTGTCTCAAGCTT GCATGAGGCAACAACTGCATT GGTGGCACCAAGCATGAGGCAACAACTGCATTACTTTCAAGGAAGTTACAAAATCTATGGGTCTTCATAATCGTGACTTTCTTGCAAGTTGTGCAGTTGCTGTCTCAAGCTTGCTGACTCC 2 0 3' arm Hordeum_vulgare mirbase MIR444 0.000000000002 osa-MIR444d 5e-22 -55.3 ((.(.((.(((((.(((((((.(((((((((.((((.((((((((((((......(((((....)))))...)))))))))))).)))).))))))))).))))))).))))).)).).)) (-55.30)