mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACATTATGGGACGGAGGGAGT TCCCTCCATAATGTAG GGCTTCCCTGTATACAGACAGAGTCATACTCCCTCCATAATGTAGTACGGTTTTTGACACTACTACATTATGGGACGGAGGGAGTACATTG 0 5 3' arm Hordeum_vulgare mirbase MIR1122 0.000005 osa-MIR1436 0.00002 -35.7 (((((..(((....)))...))))).(((((((((((((((((((((..(((...)))..))))))))))).....))))))))))..... (-35.70)