mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTTGCAGGTTTTAGGTCTAA AGACCTAGACATGCAAGTATA TCTAGCAATATATTTGCAGGTTTTAGGTCTAAGTGGTGAATATCGATCTCTGAATATATTGATAACCTTCACAAATTTGCTGATTATTTTTGTAGCGCTCTTTCATGAGAAATGATTGTCCCACATGCATATCCATGACTAAAAAAAGCAAAAAAGTAATAATTGGGTGTTGTGTTCTCACAAAGAAAGATGGAAAAGTTTAACAAAAACTTGTGAAGGAAGATGAATGCTTTGATTATGCATGAATCCATAATGATAAAGTGCTATTGAATGATCAAGTAATTTGTAAGGTTTTTATTATCTTCGCAAGAGTTGTATTGTTAATTTAGACCTAGACATGCAAGTATATTTCTAGG 2 1 5' arm Hordeum_vulgare mirbase 100 100 -103.3 .((((.((((((((((((...(((((((((((((....((((.(((.(((((((.(((.(((.((((((.(((((((.(((((((((((..((((((((((((((..((..(((..((.....))..))).(((((..((((.....((......)).....))))...(((((....)))))......)))))...............))..))))))..(((..((((.........))))..)))...........)))))))).)))))))).)))))))))))))))).))).))).)))...)))))))))))....)))))))))))))..)))))))))))).)))). (-103.30)