mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCACTCTCTATCTGTCAGC TTGTCTTGAGAGGGGAAGAGATCTCTATGGGTTTTGGAGGTCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACACGGTGCTTTCTTAGCATGCAAGAGCCATGCTGGGAGCTGTGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCAGCCGTTCACCATGCCCAATATGATTAATCTCCTTCTCTCAGTTGACAG 0 1 5' arm Oryza_sativa mirbase mir-156 3e-43 ssp-MIR156 8e-34 -94.2 .((((((((((((((.(((((((....(((((..(((.((.(((((((((((((((((((((.((((((....(((((((((((....).)))))))))))))))).))))))))))))).)))))))))).....))).)))))....))))..))).))))))))))..)))). (-94.20)