mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCACTTCTCTCTCTGTCAGC GGAGGAAGAGAGGGGTGAGAGGTGAGGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGACTTTCTTGCATGCTGAATGGACTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGCCATTTGATCTCTCTTTCTCTCTTTCTCC 0 2 5' arm Oryza_sativa mirbase mir-156 5e-38 aly-MIR156f 6e-22 -91.1 ((((((((((((..(.(((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((..(......).)))))..)))))))))))))))))).))))).))))))))))...).))))))))..)))))))))))) (-91.10)