mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCGCTCCTCTTTCTGTCAGC TTGGGGCGGGGCGGGATCGAGCATATGAAAGGCGAGATTGTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCGCGGCGGCTAGCCATCGGCGGGATGCCTGCCCCCGCCGCGTGCTCGCTCCTCTTTCTGTCAGCATCTCTCATCACTCCCTCCCGCATCCCCCGCCCCGA 0 2 5' arm Oryza_sativa mirbase mir-156 2e-43 osa-MIR156h 2e-52 -102.1 ((((((((((((((((..(((...((((.....(((((.((((((((((((((((((((((.(((((.((.(((.((.((((.....)))).)))))))))))).))))))))).))).)))))))))))))))))))..)))..))))))....)))))))))) (-102.10)