mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGAGAGCACA TGCTCTCTGATCTATCTGTCATT TTGAGAGTGATGACAGAAGAGAGAGAGCACAACCCGGCAGCAGCGACGACGGCGGTCGCTTCTGCCAGGGCCGTGTGCTCTCTGATCTATCTGTCATTGCCGTCCA 1 2 5' arm Oryza_sativa mirbase mir-156 1e-43 sbi-MIR156d 2e-17 -61.4 ..((..(..(((((((((((.((((((((((.((((((((.((((((.......)))))).))))).)))...))))))))))..))).))))))))..)..)).. (-61.40)