mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGACAGAAGAGAGTGAGCATA TGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGC GCTAGGGAGCCGACAGAAGAGAGTGAGCATATATAGTTCTTTCCTTGCATATGTGGTCATATGTGTGTTGACTGAAGAGATACATATATATAGAGAGAGAGAGTTCATGTGCTTGAAGCTATATGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGCAAATTATC 1 2 5' arm Oryza_sativa mirbase mir-156 4e-17 osa-MIR156c 0.0000000001 -59.7 ........((.((((((((((((((((((((((((((...(((...(((((((.(.(((((((((((((.........)))))))))))...........)).).)))))))..)))))))))))))))))).)))).))))))).))........ (-59.70)