mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGGATTGAAGGGAGCTCCG GAGCTCCTTTCGATCCAATTC TGATGTGAGGAGGAGCTCCTTTCGATCCAATTCAGGAGAGGAAGTGGTGGGATGCAGCTGCCGGTTCATGGATACCTCTGCAGTTCATGCCGGTAGGCCTGCACTTGCATGGGTTTGCATGACCTGGGAGATGAACCTGCCATTGTGTTCCTCTATTGATTGGATTGAAGGGAGCTCCGGCTACACCTA 1 0 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR159 2e-103 osa-MIR159c 2e-56 -100.1 ....(((((..((((((((((((((((((((.(((.(((((((((((..((...((.((.((((.(((((.(.((((.((((((.((.(((....))).)).)).)))).)))).).))))).)))).)).))..))..))))....))))))).)))))))))))))))))))))))..)).)))... (-100.10)