mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCCTTCGATCCAATCC GAAGAAGAAGACGAGCTCCCTTCGATCCAATCCAGGAGAGGAAGTGGTAGGATGCAGCTGCCGGTTCATGGATACCTCTGCAGTGCATGTCGTAGGCTTGCACTTGCATGGGTTTGCATGACCCGGGAGATGAACCCACCATTGTCTTCCTCTTATGCTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACCTCTCTC 3 0 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR159 6e-103 osa-MIR159c 3e-58 -95.5 ............((((((((((((((((((..((.(((((((((((((.((...((.((.((((.(((((.(.((((.(((((((((.((.....)).))))).)))).)))).).))))).)))).)).))..)).))))....))))))))).)).))))))))))))))))))............ (-95.50)