mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTGCAAGGAGCCAAGCATG AAGGTTTGGTTTTGATCGGCTTGAGAGCGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCATGTAGCCCAATCCATGGTGTGTTTGGATGCTGTGGGTGGCGTGCAAGGAGCCAAGCATGCGTGCCATGATCTCTCTTTCTGCCTT 2 0 5' arm Oryza_sativa mirbase mir-160 2e-43 zma-MIR160g 2e-30 -67.6 (((((..((....(((((((......((((((.(((((((.((((((((((((((..(((...(((((.........)))))))))))))))))))))).))))))).))))))..)))..))))...))....))))) (-67.60)