mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGTTCAAGG TGAAGCTATTTGCTTCTGAGTGGAATGTTGTCTGGTTCAAGGTCTCATGCACCTTGCGGTTTTGAGGATGATTTGTGCAAGGTTTTTCATTCCTCTCATCCGTGGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAGAGATAGCTTCA 4 0 3' arm Oryza_sativa mirbase mir-166 3e-58 bdi-MIR166c 3e-17 -67.16 .(((((((((....((((((.((((((..(((((((((.((((((((((.(((....)))...((((((((...............))).))))).....)))))))))).)))))))))..)))))).))))))))))))))). (-67.16)