mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGTCCGAGA GGCAGTTGAGGGGAATGTTGTCTGGTCCGAGACCTAACACCGGGCGGAATGGCGGATTCAGCTGCAGCTAAGCAAGCTAGGTGGGGGGTTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACTCAACTGTT 2 0 3' arm Oryza_sativa mirbase mir-166 9e-58 hvu-MIR166b 4e-53 -73.4 .((((((((((((((((..((((((((((((((((..((((.(((.((((.....)))).(((.......)))..))).))))..))))))))))))))))..)))))))).....)))))))). (-73.40)