mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCTC GGAATGTTGGCTGGCTCGAGG GGTGGCTTGTGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAGGTATCCACATCTTAATTCCTCTCCGGCGATCGAGCCGGCTCGGGCGTGTGGAAGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTCGCAAGCCGAT 5 0 3' arm Oryza_sativa mirbase mir-166 5e-56 zma-MIR166m 0.000000006 -67.5 ..((((((((((((((((..(.((((..(((.((.(((((((......(((...(((((......)))))...))).))))))).)).)))..)))).)..)))))))))))))))).. (-67.50)