mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCAATCCCT GGTTTGTTGTCTGGCTCGAGG ATTAGGTTAAGGGGTTTGTTGTCTGGCTCGAGGCATCCGGGACTCCGGTTTCTCCTTTCCTACTGGAGGCGCCTAATTTCCGGCGAGCTCGGAGCCTCGGACCAGGCTTCAATCCCTTTAACCATGC 5 0 3' arm Oryza_sativa mirbase mir-166 9e-61 sbi-MIR166g 0.0000000001 -69.4 ....((((((((((.(((..((((((..((((((.((((((.(((((((............))))))).((((........))))..))))))))))))..))))))..))).)))))))))).... (-69.40)