mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCAATCCCT GGATTGTTGTCTGGTTCAAGG GTTAGGTTAAGGGGATTGTTGTCTGGTTCAAGGTCTCCACATTGTGCAAAATGTTCATTCATGGAGGCACAGGATGCTTGGTGATCTCGGACCAGGCTTCAATCCCTTTAACCAGCA 3 0 3' arm Oryza_sativa mirbase mir-166 8e-55 bdi-MIR5168 0.000000000000006 -59.4 (((.((((((((((((((..(((((((((.(((((.(((((((((((...(((......)))....)))))..)))..))).))))).)))))))))..))))))))))))))))). (-59.40)