mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GGTCATGCTGCGGCAGCCTCACT TGTCCAAGGGAACGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCTGAATGATCAACAAGATGTGCTCCCACACTGCCTTCCTGTGGATCTTGAGCTGTTGCTAGTCTTGTGGTCATGCCTTGCTAGGTCATGCTGCGGCAGCCTCACTTCTTCCCATTGTTGGGCA 1 2 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR167_1 2e-81 bdi-MIR167b 4e-20 -80.6 .(((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((.....(((((((.((((((..(((((((((.........))))).....))))........))))))))))))).....)))))))))))))..)))))).)))))).)))))....)))))). (-80.60)