mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGA GGCAAGTTGTTCTTGGCTACA CGCCGGCGGCCTGACATTGGGATCGGAGGCCATGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGATCGATCGATCTATCTATGAAGCTAAGCTAGCTGGCCATGGATCCATCCATCAATTGGCAAGTTGTTCTTGGCTACATCTTGGCCCCTGCTCCTCATGTAAGGCCGGCCTGTGGCG 3 0 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR169_2 8e-62 zma-MIR169a 0.00000000004 -99.6 ((((((((((((.((((.((((.(((.(((((.((((.(((((((((..((((((((((.(((.(((..(((((((.(((((...)))))...)))))))..))).))).))))))))))..))))))))).)))).))))).))).)))).)))).))))).)))...)))) (-99.60)