mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTCTGTCCTTGGCTACA GAACGGGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCCTGGTATTGGGGGAATCTCAGCTTTGCTGAAGCGCCTTGGAGTTAGCCGGCAAGTCTGTCCTTGGCTACACCTAGCTC 1 1 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR169_2 7e-58 bdi-MIR169c 4e-25 -56.7 ....(((.((.((((((((((((((((((((((.......((.((((....(((((...)))))....)))).))...)))))))))))).)))))))))).)))))..... (-56.70)