mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGAATTGCCGG GGCAAGTCATTTCAGGCTACA ATTTATCGTGTAGCCAAGGATGAATTGCCGGCGTTTCACGCTGTTGATGGTGCGTGCATATATAAGTTGGCGCCGGCAAGTCATTTCAGGCTACATGTTTGCC 3 0 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR169_2 2e-52 vvi-MIR169v 0.00002 -46.02 ......(((((((((..((((((.(((((((((((.(((((..........)))))............))))))))))).))))))..)))))))))...... (-46.02)